校新闻中心讯 近日,九游(中国)基础医学与法医学院李冰宇博士在Nature旗下子刊,国际知名期刊《Signal Transduction and Targeted Therapy》(中科院一区TOP,IF:40.8)上发表了题为“Neo-intline: integrated pipeline enables neoantigen design through the in-silico presentation of T-cell epitope”的文章。
本研究成功设计了一种创新的计算流程——“Neo-intline”,该流程能够从肿瘤样本的SNPs和indels出发,通过集成计算模型模拟体内肽段的呈递过程。研究团队通过与TESLA基准数据集和临床验证的neoantigens进行对比验证,发现Neo-intline展现出比现有工具更优越的性能。此外,研究还通过小鼠黑色素瘤模型验证了20种neoantigens的有效性,包括10种MHC-I和10种MHC-II肽段。实验结果表明,Neo-intline预测的肽段能够显著招募相应的CD8+ T细胞和CD4+ T细胞,有效诱导T细胞介导的细胞免疫反应。此项研究不仅为个性化肿瘤疫苗的设计和筛选提供了新的思路和方法,而且有望显著提升肿瘤免疫治疗的临床效果。该研究得到国家自然科学基金、河南省科技攻关等项目的支持。
供稿/基础医学与法医学院 编辑/王璐瑶